タカラバイオ株式会社 x PacBio 共催
2024 PureTarget 受託解析グラント
タカラバイオ株式会社 x PacBio 共催
PureTarget™ Repeat Expansion Panelは、シークエンシング困難なタンデムリピート伸長を伴う20遺伝子の包括的解析を可能にするよう設計されたPacBioの新しいキットです。この新しい PCR フリーの ロングリードワークフローは、疾患の原因となるバリアントや関連するメチル化シグネチャーの解析を容易にします。
また、PureTargetは、リピート伸長領域を濃縮するための簡単でスケーラブルなワークフローを採用しており、サンプルから結果までをわずか3日で行えます。Revio™およびSequel IIシステムでシーケンスが可能で、PureTargetライブラリーは最大48サンプルを同時にマルチプレックス解析でき、20遺伝子ターゲットパネル全体にわたる深いカバレッジを生成します。
Tandem Repeat Genotyping Tool (TRGT)と高精度のHiFiリードによる深いカバレッジを活用して、PureTargetパネルは [A] リピートの単一塩基解像度、[B] 長いリピートの正確なサイズ測定、[C] メチル化プロファイル、および[D] モザイシズムを特徴付けるための深いカバレッジを提供します。
エントリーフォーム
本グラントは、タカラバイオ株式会社とPacBioが共催で提供するもので、PacBioの新製品であるPureTarget Repeat Expansion Panelを使用してタンデムリピート伸長に関する研究を行う研究者を対象とした助成制度です。
募集課題に沿った研究で、選考された方にHiFi sequencingを助成します。
1) 助成対象となる研究は、選考基準及びPureTarget Repeat Expansion Panaelに関連研究課題に沿った研究であること。なお、新規の研究のほか、すでに手がけている研究に対しても認めます。
2) 選考基準
① Puretarget™ Repeat Expansion Panelに関する基礎的な研究又は将来性ある研究で、その内容が独創的であること。
② 研究の計画・方法が研究目的を達成するために適切であること。
③ 2025年3月末までに実験材料の準備を完了し、タカラバイオ株式会社に送付可能な提案であること。
④ Hifi sequencingの受託解析サービスが無償提供されますが、他の受託解析サービスやDNA抽出キットは有償となります。
⑤ PacBio Nanobind PAN DNA Kit (PN 103-260-000)またはNanobind CBB Kit (PN 102-301-900)から抽出した高分子ゲノムDNAを提出すること。
⑥ 実験に使用するサンプルは、以下の条件を満たしていること。
• DNA input 5μg/sample
• DNA quality GQN at 30kb >5
• Mean target coverage >200-fold
• Minimum target coverage 50-fold
• Library size 4-5kb
3) 応募手続
① PacBio PureTarget受託解析グラント 研究提案書の提出
研究提案書のテンプレート：ダウンロード
② 提出期限 2024年11月15日（金）
③ 提出先 PacBio Japan Marketing (Marketing-jp@pacificbiosciences.com)
ご不明な点がございましたら、お気軽にお問い合わせください。